花户小鸠（花泽香菜配音）是一个身份神秘的天然呆少女，她的工作就是治愈“受伤的心”，然后收集治愈后的心灵所留下的透明碎片。她是怎样拥有这样的能力，其目的又究竟为何，这一切都是谜题。在一次偶然之中，小鸠......

以成为神奇宝贝大师为目标，小智（松本梨香配音）、小刚（うえだゆうじ配音）和小光（豊口めぐみ配音）带着各自的神奇宝贝在世界各地进行艰苦的修业之旅，今天他们历经长途跋涉终于来到了风景秀美的米琪亚镇。在当地一对小兄妹的介绍下，小智一行前往神殿遗址游玩。谁知却遭遇了极其危险的情况。关键时刻，掌管时间的迪亚鲁加和守卫神殿的西娜（北乃きい配音）、凯宾（岸祐二配音）帮助了他们，能与神奇宝贝心灵沟通的西娜还熄灭了...

结城梨斗（渡边明乃配音）正派开朗，细心友善。一直以来，梨斗都暗恋着青梅竹马西连寺春菜（矢作纱友里配音），可是，对于恋爱一窍不通的梨斗只是将这份强烈的感情深深的埋藏在心底。终于，梨斗再也无法压抑心中......

这是一个存在着魔法的世界，式森和树（坂口大助配音）是一个不合格的魔法师，虽然出生于魔法世家，但他一生可以使用魔法的次数仅为8次，一旦次数用完，施术者便会变成幽灵。平凡的和树准备就这样度过他平凡的一生......

最上恭子（井上麻里奈配音）是个守财奴，她疏于修饰外表，将所有的精力全都放在了打工赚钱上面。在她的心里，有一个男人的地位不得撼动，那就是现在当红的艺人不破尚（宫野守真配音），幸运的是，他们居然是邻居......